Chính phủ đã ban hành Nghị định 117/2025/NĐ-CP, quy định mới về việc thu thuế đối với hoạt động kinh doanh trên sàn thương mại điện tử (TMĐT). Đây là một bước ngoặt quan trọng trong công tác quản lý thuế đối với nền kinh tế số, đặc biệt là trong bối cảnh sự phát triển mạnh mẽ của TMĐT ở Việt Nam. Nghị định 117 có hiệu lực từ ngày 1/7/2025, áp dụng cho cả các nền tảng TMĐT trong nước và quốc tế.

Một trong những điểm mới quan trọng của Nghị định 117/2025 liên quan đến việc khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT) và thuế thu nhập cá nhân (TNCN) ngay khi người mua chấp nhận thanh toán. Trước đây, các sàn TMĐT chỉ đóng vai trò là đơn vị kết nối người bán và người mua, nhưng theo nghị định mới, sàn sẽ chịu trách nhiệm khấu trừ và nộp thuế thay cho người bán. Điều này giúp đơn giản hóa thủ tục thu thuế, đồng thời đảm bảo việc thu thuế diễn ra minh bạch và chính xác.

Thuế GTGT và TNCN sẽ được tính trên doanh thu của mỗi giao dịch hoàn tất. Theo quy định, cá nhân trong nước khi bán hàng trên sàn thương mại điện tử sẽ phải chịu các mức thuế khác nhau tùy theo nhóm hàng hóa, dịch vụ. Cụ thể, đối với nhóm hàng hóa, người bán sẽ chịu thuế GTGT là 1% và thuế TNCN là 0,5%. Với nhóm dịch vụ, mức thuế GTGT áp dụng là 5% và thuế TNCN là 2%. Trường hợp cá nhân cung cấp vận tải hoặc các dịch vụ gắn với hàng hóa, mức thuế GTGT là 3% và thuế TNCN là 1,5%.

Đối với cá nhân ở nước ngoài bán hàng qua các nền tảng online, họ phải chịu mức thuế TNCN lần lượt là 1% với hàng hóa, 5% với dịch vụ, và 2% với hoạt động vận tải hoặc dịch vụ gắn với hàng hóa.

Trong trường hợp đơn vị quản lý sàn thương mại điện tử không xác định được liệu giao dịch đó là hàng hóa hay dịch vụ, số thuế khấu trừ sẽ được áp dụng theo mức tỷ lệ cao nhất giữa thuế GTGT và thuế TNCN cho các giao dịch đó.

Việc kê khai thuế sẽ được thực hiện theo tháng, đồng nghĩa với mỗi tháng, các sàn TMĐT phải báo cáo tổng số thuế khấu trừ từ các giao dịch đã hoàn tất trong tháng đó.

Đối với các giao dịch bị hủy hoặc trả lại, các sàn sẽ có trách nhiệm bù trừ số thuế đã khấu trừ và nộp thay cho người bán. Trong trường hợp này, sàn cần thực hiện điều chỉnh và trả lại số thuế đã nộp thừa cho người bán, đảm bảo sự công bằng và chính xác trong việc thu thuế.

Theo Thông tư 40/2021, thuế GTGT và thuế TNCN đối với hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh sẽ được tính dựa trên toàn bộ doanh thu mà họ có trong kỳ kinh doanh.

Doanh thu tính thuế bao gồm tổng số tiền thu được từ việc bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ và các khoản thu khác. Các khoản chi phí như phí giao dịch, phí vận chuyển, chiết khấu, trợ giá... không được trừ đi khi tính thuế, mà chỉ được xem là chi phí kinh doanh của người bán, không ảnh hưởng đến số thuế phải nộp.

Một điểm mới đáng chú ý khác là ngưỡng doanh thu chịu thuế sẽ tăng lên 200 triệu đồng từ ngày 1/1/2026. Ngoài ra, Nghị định cũng yêu cầu hộ, cá nhân cư trú có hoạt động kinh doanh trên sàn TMĐT phải kê khai và nộp các loại thuế khác như thuế tiêu thụ đặc biệt, bảo vệ môi trường, tài nguyên theo quy định của pháp luật.